Gel-filtrlash xromatografiyasi viruslar, fermentlar va boshqa yuqori molekulyar og'irlikdagi birikmalarni tozalash va konsentratsiyalash uchun, masalan, 50% gacha tozalikni ta'minlashda qo'llaniladi. Ushbu usul 10-1000 kDa oralig'idagi oligomerlarni monomerlardan ajratish, shuningdek, biologik namunalardagi balast moddalarni tozalashda samarali.