Изомерия тушунчасини фанга бирinchi bўlib 1830 йил пайтиги Я. Берцелиус кириш чап этган. У вино кислотасини ўрганиш жараёнларида умумий атом таркиби бир хил бўлган турли моддаларни кузатади. А.М. Бутлеров томонидан органик моддаларнинг тузилиш назарияси кашф этганидан сўнг изомерия ҳадисасининг сабабларини асослаш мумкин бўлди. Изомерия тушунчаси грекча isos –тенг ва meros қисм деган сўзлардан олинган бўлиб атом таркиби ва молекуляр массаси бир хил бўлган, лекин тузилиш ва шунга мос равишда хоссалари ҳам турлича бўлган.