Bolalarda laktaza yetishmovchiligi, odatda, laktaza fermenti ishlab chiqarilishining yetarli bo'lmaganligi sababli yuzaga keladi. Bu holat genetik omillar, asosan, irsiy predispozitsiya bilan bog'liq bo'lishi mumkin. Ba'zi hollarda, vaqtincha laktaza yetishmovchiligi ichak infeksiyalari yoki oshqozon-ichak yo'llari kasalliklari natijasida yuzaga kelishi mumkin